实用小工具

由BIO-BIO-BIO参与或者协助制作的小插件，让生物数据获取、解读更轻松。

影响因子查询

影响因子指的是某一期刊的文章在特定年份或时期被引用的频率，是衡量学术期刊影响力的一个重要指标。这个小插件为您提供最近五年的期刊影响因子查询。请输入杂志的全名进行查询。（说明：信息全部来自网络上网友的贡献整理，并非官方的数据，如需精确的官方数据，请访问IF相关官方网站查询）

请输入杂志的名称

查询结果

杂志名称 总引用数 影响因子 年份

突变注释工具

CLINVAR数据库是一个完全开源、免费的数据库，描述疾病与基因变异的关联性。由美国国家生物技术信息中心（NCBI）与2013年正式启动。目前世界上大量研究机构、商业公司等的相关数据分析流程都以CLINVAR数据库作为基因突变注释的重要参考工具。这个小插件可以协助研究人员快速地检索CLINVAR数据库。(CLINVAR数据库版本：20171029)

请输入突变的染色体位置及碱基变化信息（hg19）

染色体
起始位置
突变前碱基
突变后碱基

查询结果

染色体 起始位置 突变前碱基 突变后碱基 突变名称 基因名 是否致病 突变来源

文献下载小插件

全球最大的论文免费下载网站 Sci-Hub 是由哈萨克斯籍女研究员亚历珊德拉·艾尔巴金（Alexandra Elbakyan）于 2011 年 9 月 5 日创办的。她因为研究论文成本过高，每篇论文在付费墙机制下通常需要花费 30 美元，因而决定成立 Sci-Hub 。 这个小插件帮你快速的访问Sci-Hub网站的最新地址。输入文献的PMID号即可快速下载文献。

请输入文献的PMID号

NIPT（无创产前诊断）原始数据解读工具

由上海五色石医学（ChromySky）研发，通过NIPT测序数据产生的bam文件，可快速生成染色体上的覆盖情况报告。（仅作为参考，不作为筛查和诊断的标准）

请上传bam文件（bwa/bowtie生成）（hg19版本）

  1. 数据上传中

    30%

  2. 数据上传完毕，请24h后下载报告

  3. 数据分析完成，请点击以下链接下载报告

    点击下载

基因编码区大小快速查询

编码区是细胞DNA的一部分。基因分为：编码区，非编码区。编码区是指能够转录信使RNA的部分，它能够合成相应的蛋白质。获取基因编码区的大小有助于后续实验的最优化设计。这个小插件可以根据基因的名字快速查询此基因的编码区大小。

请输入基因的名称

查询结果

基因名称 编码区大小（kb）

基因相互作用预测

基因之间，以及与编码的蛋白之间，存在相互作用和关联性。这个小插件收集了目前多个公共数据库中收集的、PUBMED 摘要中检索到同时出现的等基因相互关联数据。通过基因名称可以查询与之相互作用或者关联的基因（Tips：随着研究逐渐增多，此数据库可能不具有较强的时效性）。

请输入基因的名称

查询结果

检索基因 关联基因

基因转录起始位点附近 CpG 岛查询

基因转录起始位点附近 CpG 岛（CGI）的甲基化情况常常影响基因的表达水平。这个小插件可以帮助科研人员迅速检索到某个基因的 TSS 附近有无 CGI 以及 CGI 的具体信息。（Tips：这里采用的 TSS 附近是指 TSS 上游 5000bp 到 TSS 下游 1000bp 的区域）

请输入基因的名称

查询结果

检索基因 GENE-chrom TSSregion-chromStart TSSregion-chromEnd CGI-chrom CGI-chromStart CGI-chromEnd CGI-name CGI-length CGI-cpgNum

基因转录起始位点附近 SNP 查询

基因转录起始位点附近的 SNP（单核苷酸多态性）常常影响基因的表达水平。这个小插件可以帮助科研人员迅速检索到某个基因的 TSS 附近有无 SNP 位点以及 SNP 位点的具体信息。（Tips：这里采用的 TSS 附近是指 TSS 上游 1000bp 到 TSS 下游 200bp 的区域。此外，如果检索结果大于 20 条，则只显示前 20 条，如需所有结果，请联系我们官方邮箱）

请输入基因的名称

查询结果

检索基因 GENE-chrom TSSregion-chromStart TSSregion-chromEnd SNP-chrom SNP-chromStart SNP-chromEnd SNP-name

基因相关疾病查询

这个小插件调用的数据库依然是 CLINVAR 数据库，协助用户通过检索基因名称，快速获得目前已经研究过的与之相关的疾病。（Tips：如果检索结果大于 20 条，则只显示前 20 条，如需所有结果，请联系我们官方邮箱）

请输入基因的名称

查询结果

基因名称 疾病名字 可能突变来源
更多小工具开发中，敬请期待
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